人皇（じんのう）十代崇神（すじん）天皇の頃、出雲地方よりこの土地に氏族（うじぞく）が
移住せられ開墾改された。そして、この地の地名を「柳田郷（やなぎたごう）」と名付け彼らの祖神たる 櫛稲田姫命様（くしなだひめのみこと）、須佐之男命様（すさのおのみこと）、 大己貴尊様（おおなむちのみこと）の名（大国主命）を守護神として石上台、又の名伊勢神台 （いせのかみだい：当鎮座地北西一㎞の台地）に祀（まつ）り社殿を結構（ゆいこう）し 柳田大明神と称して地域の親睦発展は元より、子々孫々に到るまでの弥栄（いやさか）を 祈願したのである。この柳田大明神が六所神社の旧名であり、御創建は崇神天皇 甲申（こうしん）の歳といわれ、今から約２０５０年～２１００年前です。
柳田大明神の御加護の元に氏族の人々は、心を一つに和して開墾開拓に辛苦努力重ねられ
東国開発の基礎を固められ、又相模国の形成に多大なる貢献をなされた。大化の改新後、国の行政も次第に整い国司の制度が始められてゆく中に元正天皇の 御代養老二年（７１８年）閏（うるう）四月八日石上台より、現在の鎮座地に 奉遷暦勅（ほうせんれきちょく）を以って相模国八郡神祇の中心をなすべき旨宣下された。 桓武天皇天応元年（７８１年）五月五日早良親王（さがらしんのう）夷賊征討（いぞくせいとう） に際し、退壌（たいじょう）祈願あり、平安時代に入って相模の国府（今の県庁）が柳田郷の 地名も相模の国府と称せられるようになった。
大化改新以来国司は、任国に着くと先づ神拝（しんぱい）と言って国中の主たる神々を 順拝し国幣（こくへい）を頒（わか）つ制であったが、順拝は大変な日数と費用と人員を 要するため主たる神々の御分霊をあわせ祀（まる）る社（やしろ）即ち総社を設ける習いとなった。
相模国の場合、柳田大明神に、一之宮寒川神社、二之宮川勾（かわわ）神社、 三之宮比々多（ひびた）神社、四之宮前鳥（さきとり）神社、平塚の八幡宮の分霊を合わせ 祀り相模国総社の成立を見ました。又、六ヶ所の神社を合わせ祀る所から国府六所宮とも 称されるようになった。
相模国府祭（こうのまち：神奈川県無形文化財）もこの時代から「お祭り」の性格を
持つようになったと思われます。そして、鎌倉時代になると源頼朝の崇敬誠に篤く、
吾妻鏡（あづまかがみ）によると治承四年（１１８０年）十月十六日の条平家の大軍が、
平維盛を大将として富士川に攻め寄った時、国府六所宮にて戦勝祈願を行う。同年十月二十三日源頼朝は、北条時政等二十五名の功賞を行う。その規に依り、 文治二年（１１８６年）本殿の改造が行われ、建久三年（１１９２年）八月九日 源頼朝の実子実朝の安産誕生祈願の為神馬奉納「総社柳田」と記す。
建長四年（１２５２年）四月十四日宗尊親王将軍の事始に、幣帛（へいはく）神馬を 奉納以上の様に源頼朝は総社六所神宮に対する敬神の念誠に篤く、又相模国を代表する 神社として崇敬し特別扱いをしております。
戦国時代には、戦国の雄北条早雲の崇敬も大変篤く御子氏綱（うじつな）が永正年間
（１５０１～１５２０年）に六所宮の御社殿御造営、又四代目左京大夫氏政（うじまさ）公が
御本殿の御修復を行いこの本殿が現在のものでございます。天文十三年（１５４４年）十二月二十三日付の北条氏寄付状があり、相州六所領六十五貫 七十六文とある。又、大納言徳川家康も相模国六所宮に対する崇敬篤く天正十九年（１５９１年） 武運長久の祈願として六所領（一五〇〇〇坪）五十石の寄進状御朱印があり、徳川家光は 慶安元年（１６４８年）国家安全祈願として五十石の寄進状御朱印があり、以後歴代の将軍の 特別なる祈願と六所領の寄進があり明治に至っております。